【2026年版】文京区でおすすめの税理士・会計事務所12選｜エリア別の選び方と費用相場

文京区で税理士を探すとき、まず押さえておきたいのは、区内に大学病院や東京大学発のベンチャー、出版社が集積し、業種によって求められる専門性がかなり違うということです。本郷や湯島でクリニック・歯科医院を開業する院長、東大発スタートアップの役員、音羽の出版社に関わる編集者やライターでは、税理士に相談したい内容がそれぞれ異なります。

文京区の事業所数は13,761（従業者数212,735人）で、平成26年の14,316から減少傾向が続いています（令和3年経済センサス-活動調査）。一方で本郷・湯島は東京大学医学部の開設以来「都内最大の医療産業集積地」と呼ばれ、本郷キャンパス周辺は「本郷バレー」としてAI・ディープテック系のスタートアップが集まっています。

この記事では、文京区の産業構造に合わせた選び方を整理したうえで、区内のおすすめ事務所を地区別に紹介します。あわせて費用の目安やよくある質問もまとめました。開業したての院長、東大発スタートアップの役員、出版まわりのフリーランスまで、それぞれの立場で使える内容です。

文京区の税理士事情｜まず知っておきたい3つの特徴

まず、文京区がどんな事業者で成り立っている街かを押さえておきましょう。ここで挙げる3つの特徴は、後半の選び方にそのままつながります。

本郷バレー、東大発ベンチャーの集積地

東京大学関連ベンチャーの累積創出数は638社（2024年度・東京大学発表）にのぼり、経済産業省「令和6年度大学発ベンチャー実態等調査」でも東大は現存企業数468社と全国最多です。本郷キャンパス周辺は「本郷バレー」と呼ばれ、直近10年でAI・ディープテック・医療系のスタートアップ約350社が集まったとされています。

これらの企業では、研究開発税制やストックオプション、VC調達後の会計体制構築など、スタートアップ特有の税務が絡みます。役員として税理士を選ぶなら、創業融資だけでなく資本政策や決算体制の構築まで相談できるかどうかを見ておきたいところです。

大学病院と歯科医院が集積する、医療の街

文京区には東大病院（本郷7-3-1）・順天堂医院（本郷）・東京科学大学病院（湯島）・日本医科大学付属病院（千駄木）と大学病院が集中し（文京区 医療施設一覧）、周辺には勤務医からの独立開業クリニックや歯科医院が多くあります。区内の歯科診療所は148軒にのぼります。

医療機関の税務では、医療法人化（持分なし医療法人の設立認可）やMS法人の設立、本体クリニックとMS法人の取引価格・理事報酬の設定など、一般の法人とは異なる論点が出てきます。契約前に、どこまでが顧問料に含まれるかを具体的に確認しておく必要があります。

出版・編プロと個人商店が残る、2税務署体制の区

護国寺駅前の音羽地区には講談社本社（音羽2-12-21）を中心に出版社が集積し、音羽だけで出版社21件が登録されています。出版・編集プロダクションで働くフリーランスの編集者・ライターは、原稿料の源泉徴収やインボイス対応、印税収入の申告が主な相談内容になります。

また文京区は本郷税務署（西片2-16-27）と小石川税務署（春日1-4-5）の2税務署管轄に分かれ、税理士会も東京税理士会の本郷支部・小石川支部の2支部体制です。千駄木・根津（谷根千エリア）には商店街と個人商店が残り、個人事業主の記帳・確定申告の需要も根強くあります。

文京区で失敗しない税理士の選び方

ここからは、文京区で税理士を選ぶときに見ておきたい5つのポイントを紹介します。5つすべてを満たす一社を探す必要はありません。自分の業種や事業形態に関わる項目から順に確かめていきましょう。

医業・クリニック特化で選ぶ

本郷・湯島は大学病院からの独立開業が多いエリアです。クリニックや歯科医院の税務は、一般の法人とは勘所が違います。医療法人化のタイミング、社会保険診療報酬の扱い、MS法人との取引整理など、開業医特有の論点に慣れているかどうかが最初の分かれ目になります。

文京区には開業医の経理・税務に特化した事務所や、クリニックの開業支援・補助金申請まで対応する事務所があります。医療機関の関与実績や、医療法人設立の支援実績を、料金より先に確認しておくとよいでしょう。

事業形態（個人事業主・フリーランス・法人）で選ぶ

文京区は音羽の出版・編プロ関係者や谷根千の個人商店など、個人事業主・フリーランスの比率が比較的高いエリアです。法人の顧問実績が中心の事務所と、個人の確定申告や自計化支援を得意とする事務所とでは、料金体系も対応の細かさも変わってきます。

フリーランスなら、原稿料の源泉徴収や経費按分、インボイス登録の要否といった相談に慣れているかを確認しましょう。法人成りを考えているなら、設立前後の両方に対応できる事務所を選ぶと、切り替えの手間を減らせます。

女性税理士・相談しやすさで選ぶ

税理士との相性は、専門性と同じくらい重要な要素です。とくに家庭の資産や事業の細かい事情まで話すことになる顧問契約では、話しやすさが継続のしやすさに直結します。文京区には女性税理士が代表を務める事務所もあり、相談しやすい窓口を求める人の選択肢になります。

相談のしやすさは、初回面談で誰が対応するか、質問への回答が具体的かどうかで見極められます。無料相談を用意している事務所が多いので、契約前に実際に話してみることをおすすめします。

担当者との相性・面談での見極めで選ぶ

本郷の東大発ベンチャーのように、経営判断のスピードが求められる会社では、税理士が「相談相手」として機能するかどうかが重要になります。数字を伝えるだけの関係より、資金調達や組織づくりの相談にも乗ってくれる担当者かどうかを見ておきたいところです。

面談では、こちらの事業内容への理解度や、質問に対する返答の速さ・具体性を確認しましょう。所長税理士が直接対応する事務所か、複数名体制で分担する事務所かによっても、相性の合わせ方が変わってきます。

顧問契約の範囲・更新条件で選ぶ

顧問料に何が含まれるかは、契約前に必ずすり合わせておきたいポイントです。とくに医療法人やMS法人を持つクリニックでは、本体とMS法人の両方を顧問料に含めるのか、別契約にするのかで年間コストが大きく変わります。

記帳代行や年末調整、決算料が別料金なのか込みなのか、契約更新のタイミングや解約時の条件まで、料金表に明記されているかを確認しましょう。書面やメールで範囲を確認できる事務所であれば、後々の認識違いを防げます。

文京区で税理士に依頼する前の注意点

候補が絞れてきたら、契約を交わす前に次の3点を確かめておきましょう。細かい点に見えますが、契約後の行き違いを減らすのに効いてきます。

専門外の業務は切り分けて考える

税理士は税務全般に対応できますが、相続や国際税務、医療法人化など高度な専門分野は、事務所によって得意・不得意がはっきり分かれます。本郷の事務所には相続専門をうたう事務所もあれば、創業支援やクラウド会計を主軸にする事務所もあります。

自社や自分が将来的に相続や事業承継、医療法人化などを控えているなら、その分野を主軸に据えている事務所か、必要に応じて専門家と連携できる体制があるかを、契約前に確認しておくと安心です。

コミュニケーションの齟齬を防ぐ

税理士との連絡手段や頻度は、事務所ごとに大きく異なります。メールや電話中心の事務所もあれば、チャットツールでのやり取りに対応する事務所もあります。日常的にどの手段でやり取りしたいかを、最初に伝えておきましょう。

専門用語を使わずに説明してくれるかどうかも、長く付き合ううえで重要なポイントです。初回相談で、こちらの質問に対して分かりやすい言葉で答えてくれるかを確かめておくと、契約後の行き違いを減らせます。

登録番号・所属支部を確認する

税理士の登録状況は、日本税理士会連合会の税理士情報検索サイトで誰でも確認できます。文京区は東京税理士会の本郷支部・小石川支部が担当エリアです。候補が見つかったら代表者の氏名を検索サイトに入力し、登録の有無と所属支部を照らし合わせておくと安心です。

とくに個人の税理士事務所やホームページの情報が少ない事務所を検討する場合は、登録番号を明記しているか、検索サイトで実在が確認できるかを、契約前の最低限のチェックとして行いましょう。

文京区でおすすめの税理士・会計事務所12選

ここからは、文京区内のおすすめ事務所を地区別に紹介します。本郷・湯島の医療機関や東大発ベンチャー向けの事務所から、小石川・茗荷谷、千駄木・本駒込・白山・大塚の地域密着の事務所まで、タイプ別に選びました。下の表で主な特徴を比較できます。各事務所の詳しい紹介は、表の下に続けて掲載しています。

まずは本郷・湯島・お茶の水エリアの事務所です。東大や大学病院に近く、開業医や創業間もない法人からの相談が多いエリアです。

本郷｜瀧澤緑税理士事務所

瀧澤緑税理士事務所は、本郷三丁目にある女性税理士の事務所です。記帳代行を含めた月額顧問料1万円からと、料金の分かりやすさを打ち出しています。

初回相談は無料で対応しており、個人事業主から小規模法人まで、税理士に初めて相談する人にも入りやすい窓口です。

女性税理士に話しやすさを求める人や、まずは低めの料金から顧問契約を始めたい個人事業主に向いています。

こんな人におすすめ：女性税理士に相談したい 個人事業主・小規模事業者。

本郷｜谷澤佳彦税理士事務所

谷澤佳彦税理士事務所は、本郷五丁目にある相続税専門の事務所です。ファイナンシャルプランナーの資格も持つ代表が、相続税の簡易試算を5,000円という料金で提供しています。

初回面談は無料で、相続税がかかるかどうかを早い段階で把握したい人に向いた入り口を用意しています。生前対策から申告実務まで、相続に絞った専門性が強みです。

親の相続や自身の資産承継を、専門特化の事務所にじっくり相談したい人に向いています。

こんな人におすすめ：相続税を専門家に相談したい 人。生前対策を早めに始めたい人。

本郷｜税理士事務所エールパートナー

税理士事務所エールパートナーは、本郷四丁目にある認定経営革新等支援機関です。創業融資や補助金の申請支援に力を入れ、クリニックの開業支援や社会福祉法人の会計にも対応します。

以前は音羽に事務所を構えていましたが、現在は本郷に移転しています。医療機関の開業から日常の経理まで、開業直後の手続きが多い時期に頼れる体制です。

これから開業するクリニックの院長や、創業融資・補助金をまとめて相談したい事業者に向いています。

こんな人におすすめ：クリニックの開業や創業融資・補助金 を相談したい院長・事業者。

本郷｜山本文則税理士事務所

山本文則税理士事務所は、本郷二丁目にある会社設立支援に力を入れた事務所です。会社設立を機に顧問契約を結ぶと、設立後3か月間の顧問料が無料になるプランを用意しています。

月額顧問料は1万円からと、法人成りしたばかりの事業者でも始めやすい料金です。黒字化に向けた支援を掲げ、設立直後の資金繰りや経理体制づくりを重視しています。

法人成りを考えている個人事業主や、設立直後のコストを抑えたい経営者に向いています。

こんな人におすすめ：これから法人成りする 個人事業主。設立直後のコストを抑えたい経営者。

湯島・お茶の水｜税理士法人ISYパートナーズ

税理士法人ISYパートナーズは、湯島のお茶の水プラザビルにある事務所です。美容室やサロンの経営コンサルティングを100店舗以上手がけてきた実績を持ちます。

確定申告や会社設立の無料サポートにも対応し、開業したばかりの美容室・サロンオーナーが相談しやすい体制を整えています。業種特化の知見を、日々の経理相談にも生かしています。

美容室やサロンを経営する個人事業主・法人に向いています。

こんな人におすすめ：美容室・サロンを経営する 個人事業主・法人。

湯島｜古賀俊行税理士事務所

古賀俊行税理士事務所は、湯島三丁目にある開業医の経理・税務に強い事務所です。認定経営革新等支援機関として、起業・会社設立の相談や相続シミュレーションにも対応します。

開業医特有の経理処理に慣れているため、勤務医から独立したばかりのクリニックでも、日々のやり取りをスムーズに進めやすいのが特徴です。

開業医として独立したばかりの院長や、将来の相続まで見据えて相談したい人に向いています。

こんな人におすすめ：開業医として独立したばかり の院長。将来の相続も見据えたい人。

続いて、小石川・茗荷谷・後楽園エリアの事務所です。春日・後楽園周辺のクリニックや、複数の専門家連携が必要な相続案件に向いた事務所があります。

小石川・茗荷谷｜税理士司法書士総合事務所タクミパートナーズ

タクミパートナーズは、茗荷谷駅近くの小石川五丁目にある事務所です。税理士・司法書士・公認会計士が在籍し、相続と不動産をまとめて相談できる体制を強みにしています。

不動産の名義変更や登記が絡む相続では、税理士だけでは完結しない手続きが多く発生します。士業を横断したワンストップ対応により、窓口を分けずに進められる点が特徴です。初回相談は無料です。

不動産を含む相続や、複数の専門家の連携が必要な案件を相談したい人に向いています。

こんな人におすすめ：不動産を含む相続を専門家の連携で 進めたい人。

本郷・後楽園｜江川税理士事務所

江川税理士事務所は、後楽園・水道橋にほど近い本郷一丁目にある事務所です。お金をかけずに自計化を進めるIT活用を掲げ、電子申告やインボイス対応の発信にも力を入れています。

会計ソフトを自社で使いこなせるようにする支援を重視しており、記帳を丸ごと依頼するより、自分たちで経理を回せる体制を作りたい事業者に向いています。

経理のIT化・自計化を進めたい個人事業主やフリーランス、小規模法人に向いています。

こんな人におすすめ：経理を自分たちでIT化したい フリーランス・小規模事業者。

最後に、谷根千（千駄木・本駒込・白山）と大塚エリアの事務所です。個人商店や個人事業主の記帳・確定申告相談に強い事務所が多くあります。

千駄木｜門田睦美税理士・社労士事務所

門田睦美税理士・社労士事務所は、千駄木二丁目にある税理士と社会保険労務士のダブルライセンス事務所です。税務と労務をひとつの窓口でまとめて相談できるのが特徴です。

英語での対応にも応じており、外国人スタッフを雇用する事業者や、海外との取引がある事業者からの相談にも対応しやすい体制です。

労務まで含めてワンストップで相談したい事業者や、英語でのやり取りを希望する事業者に向いています。

こんな人におすすめ：労務まで一緒に相談したい 事業者。英語対応を希望する事業者。

本駒込｜山口陽一税理士事務所

山口陽一税理士事務所は、本駒込五丁目にある事務所です。TKC全国会の会員として毎月の巡回監査を行い、認定経営革新等支援機関としてデジタル化支援にも対応します。

相続・贈与の相談にも対応しており、日々の月次決算の質を重視しながら、資産承継の相談にも応じられる体制です。

毎月の巡回監査で数字の精度を重視したい法人や、相続・贈与を合わせて相談したい人に向いています。

こんな人におすすめ：毎月の巡回監査で数字の精度 を重視したい法人。

白山｜飯田幸洋税理士事務所

飯田幸洋税理士事務所は、白山四丁目にある事務所です。サービス業・小売業の中小企業に加え、医師や弁護士など専門職の個人事業主を主な対象としています。

料金は3つのプランから選べる形式で、事業規模や依頼したい業務範囲に応じて選びやすくなっています。個人事業主特有の経費按分や確定申告に慣れているのが強みです。

サービス業・小売業の中小企業や、医師・弁護士など専門職の個人事業主に向いています。

こんな人におすすめ：専門職の個人事業主（医師・弁護士等）。サービス業・小売業の中小企業。

大塚｜福生会計事務所

福生会計事務所は、大塚三丁目にある事務所です。TKC全国会の会員として毎月の巡回監査・月次決算を行い、資金繰りや融資の相談にも対応します。

代表の福生昌宏氏のもと、日々の記帳から融資対策まで、地域に根ざした対応を続けています。初回相談は無料です。

資金繰りや融資の相談を、月次決算をベースに進めたい法人・個人事業主に向いています。

こんな人におすすめ：資金繰り・融資を月次決算ベースで 相談したい法人・個人事業主。

文京区の税理士費用の相場・目安

文京区でも費用は年商と訪問頻度でおおよそ決まります。月額顧問料とは別に、決算料（顧問料の3〜4カ月分が一般的）がかかる点を押さえておきましょう。区内には記帳代行込みで月1万円からの事務所や、設立直後の顧問料を一定期間無料にする事務所もあり、個人事業主や創業期でも頼みやすい水準です。下の表は、区内の事務所が公開している料金をもとにした目安です。

個人事業主の目安

法人の目安

医療法人化やMS法人の設立、相続税申告などの専門業務は、上記の顧問料とは別に料金が設定されます。相続税申告は遺産総額の0.5〜1%が一つの目安です。訪問頻度やクラウド活用の度合いで月額は変わるため、金額だけでなく、含まれる業務の範囲とセットで判断しましょう。

まとめ｜専門性と相談のしやすさで2〜3社を比較する

文京区は、本郷・湯島の医療機関や大学発ベンチャー、音羽の出版関係者など、専門性が求められる読者が多いエリアです。医業や創業支援に強いか、個人事業主・フリーランスへの対応に慣れているか、顧問契約の範囲が明確か。こうした軸で絞り込むと、候補を選びやすくなります。

候補が2〜3社に絞れたら、無料相談で実際に話し、説明の分かりやすさと提案の具体性を見比べてみてください。担当者との相性は、最初の面談で確かめておくと安心です。